Oskarżony m.in. o masakrę w Srebrenicy
Od 1997 Karadżić był poszukiwany przez Międzynarodowy Trybunał Karny dla byłej Jugosławii w Hadze. Akt oskarżenia obejmuje ludobójstwo, zbrodnie przeciwko ludzkości, naruszenia praw i obyczajów wojny oraz naruszenia Konwencji Genewskich; dotyczy także głośnej masakry Bośniaków w Srebrenicy w 1995.