6z7
W 2003 został laureatem Medalu Świętego Brata Alberta
Postanowieniem prezydenta Bronisława Komorowskiego z 9 listopada 2011 abp Gocłowski został odznaczony Orderem Orła Białego. W 2006 roku duchowny otrzymał Złoty Medal Zasłużony Kulturze Gloria Artis. Nadano mu też tytuł honorowego obywatela Gdyni (2002 rok), Redy (2007 rok), Sopotu (2008 rok), a także Wejherowa.
W 2006 roku abp Gocłowski odmówił przyjęcia tytułu honorowego obywatela Gdańska w obliczu podejrzeń o jego przyznanie w ramach zbliżającej się kampanii wyborczej do wyborów samorządowych. W 2008 otrzymał Honorowe Wyróżnienie za Zasługi dla Województwa Pomorskiego.