O aresztowaniach poinformowano, kiedy rozpoczął się proces domniemanego głównego przywódcy organizacji, Abu Bakara Baszira, oskarżonego o zdradę i terroryzm.
Dżema Islamija podejrzewa się o zorganizowanie październikowego zamachu na Bali, w którym zginęły 202 osoby. Uważa się też, że organizacja ta powiązana jest z siatką terrorystyczną Osamy bin Ladena.
Dotychczas zatrzymano 30 osób powiązanych z zamachem na Bali.