Zarazem prokuratura podała, że jeszcze 27 maja do odrębnego postępowania wyłączono wątek niezawiadomienia prokuratury przez premiera Leszka Millera o korupcyjnej propozycji Rywina wobec Agory.
Część mediów i polityków zarzucała Millerowi, że nie powiadomił prokuratury o przestępstwie Rywina od razu po słynnej konfrontacji w swoim gabinecie z lipca 2002 r. między Rywinem i naczelnym "Gazety Wyborczej" Adamem Michnikiem. Stowarzyszenie pomocy ofiarom przestępstw "Katon" złożyło wniosek do prokuratury o przestępstwie niedopełnienia obowiązków przez Millera. Sprawę tę Prokuratura Apelacyjna włączyła pierwotnie do głównego śledztwa przeciw Rywinowi.
Prokuratura oddaliła natomiast wniosek dowodowy obrony Rywina o ponowne przesłuchanie redaktora naczelnego "Gazety Wyborczej" Adama Michnika. Jak poinformował PAP rzecznik PA Zbigniew Jaskólski, bez rozpatrzenia pozostawiono zaś wniosek obrońców, by ukarać Michnika za nieodpowiadanie na ich pytania, gdyż "nie mieści się to w granicach wniosku dowodowego".
W trwającym od końca grudnia 2002 r. śledztwie prokuratura postawiła Rywinowi zarzut płatnej protekcji, za co grozi do 3 lat więzienia. Zastosowano wobec niego środki zabezpieczające: zakaz opuszczania kraju, zatrzymanie paszportu i 500 tys. zł poręczenia majątkowego na hipotece nieruchomości.
